本作为2005年发售的《宝可梦 不可思议的迷宫 青/赤之救援队》的重制版。在游戏中，玩家醒来后发现自己变成了一只宝可梦，需要通过和其他宝可梦成为朋友，并前往探索不断变化的迷宫，从而解开自己的变化之谜。